① 可以單獨訴加盟商商標侵權嗎
法律分析：可以。商標侵權是民事糾紛，按照民事訴訟程序就可以了。
法律依據：《中華人民共和國民法典》
第一百二十條 民事權益受到侵害的，被侵權人有權請求侵權人承擔侵權責任。
第一百八十三條 因保護他人民事權益使自己受到損害的，由侵權人承擔民事責任，受益人可以給予適當補償。沒有侵權人、侵權人逃逸或者無力承擔民事責任，受害人請求補償的，受益人應當給予適當補償。
第一千一百六十七條 侵權行為危及他人人身、財產安全的，被侵權人有權請求侵權人承擔停止侵害、排除妨礙、消除危險等侵權責任。
第一千一百六十八條 二人以上共同實施侵權行為，造成他人損害的，應當承擔連帶責任。
② 加盟糾紛一般都是誰贏
加盟商與加盟公司相比在加盟糾紛訴訟中處於明顯的弱勢地位。
1、加盟合同的條款對加盟公司有利。加盟合同都是加盟公司預先提供的格式版本，加盟商在簽訂加盟合同時沒有修改的權利，加盟公司早已在加盟合同中寫明了對自己有利的條款。
2、加盟糾紛的管轄法院在加盟公司所在地。加盟公司在加盟合同中預先寫好了，起訴必須在「甲方所在地」或「合同簽訂地」，也就是在加盟公司所在地法院管轄。加盟商往往都是異地加盟，如果要起訴加盟公司，必須異地起訴，付出更多費用和時間。而加盟公司在本地應訴，以逸待勞。
3、加盟公司訴訟經驗更豐富。加盟商作為個人，可能是一生中第一次打官司去法院。而加盟公司面對許多加盟商，加盟糾紛訴訟只是加盟公司日常業務，是公司運營的正常工作。
4、加盟公司是團隊，加盟商是個人。人力、物力、財力，無論從哪一方面講，加盟公司都比加盟商個人有優勢。
5、加盟合同糾紛案件，法律上定義為「特許經營合同糾紛」案件，屬於知識產權案件，完全不同於一般的民事糾紛案件或合同糾紛案件，有特殊的法律規定，審理程序更為復雜。相對沒有任何經驗的加盟商個人而言，參加訴訟更為困難。
(2)加盟店侵害商標權由誰承擔責任擴展閱讀：正是基於上述情況，國家制訂了《商業特許經營管理條例》、《商業特許經營信息披露管理辦法》、《商業特許經營備案管理辦法》等三部法律法規用以規范加盟公司，保護加盟商。?（網站可查看加盟合同糾紛相關法律法規）
法律依據：《商業特許經營管理條例》第十二條規定，
特許人和被特許人應當在特許經營合同中約定，被特許人在特許經營合同訂立後一定期限內，可以單方解除合同。