A. 加盟连锁药店不用缴税吗
药类是不要的
B. 医药公司的连锁门店需要办税务登记证吗
当然要办理税务登记了，不是法人只要取得了营业执照就要办理税务登记，贵公司已经违法3年了，没有税务登记和申报缴纳税款是要罚款（即使总公司缴纳也不行）。
建议赶快办理。
如果连营业执照也没有就要赶快办理营业执照。连锁也不行。
C. 药店加盟的连锁，想要办个税务登记证需要什么手续，还有纳税最低标准时多少
需要填写税务登记申请表，带法人/股东身份证复印件、营业执照副本、组织机构副本（原件及复印件）租赁合同（贴印花税）、公章 并缴纳登记证工本费（有的地区规定免缴）。然后再国地税报道，纳税最低标准没有规定，你开业之初没开票不用交税，开票之后交税，具体多少那就到时候会计会让你交最少的。
D. 连锁药店如何上税，有哪些税种需要缴纳
流转税：增值税、城建税、教育费附加、地方教育费附加等
所得税：注册形式是企业的，适用企业所得税，如果独立核算，自行缴纳，集团公司非独立核算，与总机构一起缴纳；
注册形式是个体户或私营合作公司，则缴纳个人所得税。
印花税,如果签订合同，需要缴纳印花税（如租赁房屋0.1%，购销万分之五
E. 开药店需要交纳哪些税
开药店一般需要缴纳的税：
应当向国税部门申报缴纳4%的增值税，向地税局申报缴纳增值税的7%城建税和3%教育费附加，以及个人所得税2%左右。如果销售收入在5000元以下的，免征增值税、城建税、教育费附加。
税务部门对个体工商户一般都实行定期定额办法执行，也就说会按区域、地段、面积、设备等核定给你一个月应缴纳税款的额度。
生产型增值税指在征收增值税时，只能扣除属于非固定资产项目的那部分生产资料的税款，不允许扣除固定资产价值中所含有的税款。该类型增值税的征税对象大体上相当于国内生产总值，因此称为生产型增值税。
(5)药店连锁加盟店税务问题扩展阅读：
营业税改增值税税率
改革之后，原来缴纳营业税的改交增值税，增值税增加两档低税率6%(现代服务业)和11%(交通运输业)。
营业税改增值税主要涉及范围：交通运输业和部分现代服务业，交通运输业包括：陆路运输、水路运输、航空运输、管道运输。现代服务业包括：研发和技术服务、信息技术服务、文化创意服务、物流辅助服务、有形动产租赁服务、鉴证咨询服务。
根据上海试点的经验，改革之后企业的税负有所降低。营业税是按收入全额计算缴纳税金的，改成增值税之后，可以扣除一些成本及费用，实际上可以降低税负。
改革试点行业总体税负不增加或略有下降。对现行征收增值税的行业而言，无论在上海还是其他地区，由于向试点纳税人购买应税服务的进项税额可以得到抵扣，税负也将相应下降。
12万户试点企业中，对3.5万户一般纳税人而言，由于引入增值税抵扣，与原营业税全额征收相比，税负会有所减少甚至大幅降低;对8.5万户小规模纳税人而言，营业税改增值税后，实行3%的征收率，较原先营业税率要低2个百分点。改革的确存在个别企业税负增加的情况。
F. 想问有没有从事连锁加盟药店的账务处理的会计，一定需要购增值税开票机吗要怎么报，能详细点吗
如果是一般纳税人，就必须购买税控设备。至于怎么报，到时金穗公司会对其培训几天。
G. 连锁店如何纳税
各省、自治区、直辖市、计划单列市财政厅(局)、国家税务局： 为支持连锁经营的发展，根据《增值税暂行条例》第22条的有关规定，现对连锁经营企业实行统一缴纳增值税的有关问题通知如下： 一、对跨地区经营的直营连锁企业，即连锁店的门店均由总部全资或控股开设，在总部领导下统一经营的连锁企业，凡按照国内贸易部《连锁店经营管理规范意见》(内贸政体法字[1997]第24号)的要求，采取微机联网，实行统一采购配送商品，统一核算，统一规范化管理和经营，并符合以下条件的，可对总店和分店实行由总店向其所在地主管税务机关统一申报缴纳增值税： 1.在直辖市范围内连锁经营的企业，报经直辖市国家税务局会同市财政局审批同意； 2.在计划单列市范围内连锁经营的企业，报经计划单列市国家税务局会同市财政局审批同意； 3.在省(自治区)范围内连锁经营的企业，报经省(自治区)国家税务局会同省财政厅审批同意； 4.在同一县(市)范围内连锁经营的企业，报经县(市)国家税务局会同县(市)财政局审批同意。 二、连锁企业实行由总店向总店所在地主管税务机关统一缴纳增值税后，财政部门应研究采取妥善办法，保证分店所在地的财政利益在纳税地点变化后不受影响。涉及省内地、市间利益转移的，由省级财政部门确定；涉及地、市内县(市)间利益转移的，由地、市财政部门确定；县(市)范围内的利益转移，由县(市)财政部门确定。 三、对自愿连锁企业、即连锁店的门店均为独立法人，各自的资产所有权不变的连锁企业和特许连锁企业，即连锁店的门店同总部签订合同，取得使用总部商标、商号、经营技术及销售总部开发商品的特许权的连锁企业，其纳税地点不变，仍由各独立核算门店分别向所在地主管税务机关申报缴纳增值税。 抄送：国务院办公厅，国家经贸委，国内贸易部，各省、自治区、直辖市、计划单列市地方税务局，财政部驻各省、自治区、直辖市、计划单列市财政监察专员办事处
H. 如果开一家零售药店，涉及的税项有哪些
药品经销业务涉及增值税、城建税、教育费附加、企业所得税等。
关于统一纳税问题，可参考财税[2003]1号和国税发[1998]137号文件这两个文件，文件不在发布了，网上到处都有。
财政部 国家税务总局关于连锁经营企业有关税收问题的通知
财税[2003]1号
2003-02-27财政部 国家税务总局
各省、自治区、直辖市、计划单列市财政厅（局）、国家税务局、地方税务局：
为贯彻落实《国务院办公厅转发国务院体改办、国家经贸委关于促进连锁经营发展若干意见的通知》（国办发〔2002〕49号）的精神，支持连锁经营的发展，现将连锁经营企业实行统一缴纳增值税、所得税的有关问题进一步明确如下：
一、 在省、自治区、直辖市、计划单列市内跨区域经营的统一核算的连锁企业，需要实行由总机构向其所在地主管税务机关统一申报缴纳增值税的，按照财政部、国家税务总局《关于连锁经营企业增值税纳税地点问题的通知》（财税字〔1997〕97号）的有关规定办理。
二、根据《中华人民共和国企业所得税暂行条例》和《中华人民共和国企业所得税暂行条例实施细则》的有关规定，对内资连锁企业省内跨区域设立的直营门店，凡在总部领导下统一经营、与总部微机联网、并由总部实行统一采购配送、统一核算、统一规范化管理，并且不设银行结算账户、不编制财务报表和账簿的，由总部向其所在地主管税务机关统一缴纳企业所得税。依照《中华人民共和国外商投资和外国企业所得税法》和《中华人民共和国外商投资和外国企业所得税法实施细则》的有关规定，对从事跨区域连锁经营的外商投资企业，由总机构向其所在地主管税务机关统一缴纳企业所得税。
三、 上述跨区域经营的连锁企业实行统一缴纳增值税、所得税后，各级财政部门要认真贯彻执行国办发〔2002〕49号文件的精神，及时制定统一纳税后所属地区间财政利益调整办法，妥善处理好各级财政利益分配关系，以确保连锁企业门店所在地的财政利益在纳税地点变化后不受影响，以利于连锁经营的发展。
财政部 国家税务总局
二○○三年二月二十七日
希望这个文件对你有所帮助！！！